有報道指，廣深港高鐵西九龍總站連接隧道（南）地面有積水，牆身亦有滲水。
港鐵回應表示，相關水跡或輕微滲水，屬工程標準上容許出現的狀況，無影響隧道及車站的結構安全、機電設施及測試營運工作。
港鐵指，連續牆的土木結構符合地下水防滲要求，設計和建造已盡量防止地下水滲入，但在工程技術上難以達到百分百防水，地下水可能由泥石層透過連續牆接縫滲出，情況並不罕見。
資深土木工程師倪學仁表示，連續牆的接縫位置，即使設計完善，基於施工困難或會滲水，屬連續牆的缺點，只要滲水情況不嚴重，加上有妥善渠道排水，問題不大。
土力工程處前處長陳健碩則指，西九總站位置水壓較大容易滲水，相信鐵路不會因而未能運作，但機電設施較容易受影響，港鐵要特別留意。
